Адрес: ул. Розы Люксембург, 38.

Здание построено в историческом районе «Пески» на месте первой «Каменной» синагоги в 1902 году на пожертвования купцов и членов еврейской общины (главным образом, купца Ильи Леонтьевича Фуксмана). Постройка нового здания была завершена в сравнительно короткое время по проекту неизвестного архитектора. В синагоге, не позднее 1911 г., была установлена позолоченная памятная стенная доска в честь Л.И. Фуксмана – жертвователя средств на строительство здания.

Синагога представляет собой двухсветный массивный объем на высоком цоколе с выступающей в центре восточного фасада небольшой алтарной частью со скругленными углами. Здание перекрыто цилиндрическим сводом, алтарный выступ – коробовым сводом, переходящим в конху. В ходе эксплуатации первоначальная планировка здания изменена полностью (Информация предоставлена Департаментом по культуре и туризму Томской области).

Освящение Хоральной синагоги состоялось 15 (28) сентября 1902 г. В газетах отмечали изящную мебель и искусную отделку помещений. Здание вмещало до 800 человек.

В 1910 г. во дворе Хоральной синагоги был открыт «Дом призрения престарелых евреев имени Лидии и Исаака Быховских». Первым председателем правления был И.С. Быховский, а первой попечительницей – его жена Л.Д. Быховская. Этот дом был организован по образцу домов призрения Германии и считался одной из лучших богаделен Сибири.

26 марта 1920 г. городской исполком постановил национализировать здание со всем имуществом. 2 августа этого же года еврейская община заключила договор с местными властями, согласно которому она получила право пользования молитвенным домом и культовым имуществом. Техническое состояние здания синагоги оценивалось как хорошее. В октябре 1929 г. решением президиума исполкома Томского горсовета синагога была закрыта.

Здание передали агентству «Кино-Сибирь» под кинотеатр для трудящихся. Но его открытия трудящиеся так и не дождались. Здание было перестроено: разрушена башенка со звездой Давида, сделан главный вход со стороны улицы, при сооружении внутренних перегородок повреждена конструкция потолка, которая фиксировала стены. Следствием этого стало отклонение стен здания от вертикали. Ситуацию усугубила постройка межэтажного перекрытия. Помещение синагоги было разделено на два этажа и разбито на маленькие комнатки. Потолок, богато украшенный лепниной, был забит досками и покрашен известью.

Во время Великой Отечественной войны 1941-1945 гг. в здании бывшей хоральной синагоги размещались эвакогоспитали. В 1944 г. на втором этаже бывшей синагоги разместился Томский областной суд. 26 ноября 1999 г. постановлением мэра Томска Александра Сергеевича Макарова аварийное к тому времени здание синагоги было передано еврейской общине в безвозмездное пользование сроком на 49 лет. В этом же году был создан Томский городской некоммерческий фонд восстановления синагоги, который возглавил Ю. Зельвенский. К работам по укреплению здания были привлечены специалисты проектной организации «Вогтехпроект». К декабрю 2002 г. здание синагоги было частично восстановлено: убран второй этаж, к возведенным в зале колоннам были притянуты стены, заменены окна, забетонирован пол. В начале 2008 г. ОАО «Сибирский институт “Сибспецпроектреставрация”» был заказан новый проект реставрации, а израильскому архитектору И. Фельдблюму – оформление интерьера. Всеми восстановительными работами руководил исполнительный директор по строительству М.Б. Пятов. 15 ноября 2010 г. реконструкция Томской хоральной синагоги завершилась установкой купола, увенчанного шестиконечной звездой Давида. Торжественное открытие хоральной синагоги состоялось 7 декабря 2010 г.

В настоящее время в здании синагоги находятся приемная раввина, приемная председателя Томской еврейской религиозной общины, приемная председателя попечительского совета синагоги, женский клуб «Лаиша», вечерне-воскресный лицей «Ор Авнер», проводятся занятия в рамках студенческой программы «STARS», работают компьютерный класс и кафе, редакция газеты «Менора», магазин предметов иудаики и библиотека еврейской книги. При синагоге, в собственном здании, 27 октября 2013 г. открылись еврейские ясли-сад имени Аркадия Гитмана.